Nato a Goteborg il 13 maggio 2000, Emil Holm è cresciuto calcisticamente nelle giovanili dell’IFK Goteborg: promosso in Prima Squadra all’inizio della stagione 2019, ha fatto il suo esordio in Allsvenskan – massimo torneo calcistico svedese – a 19 anni, collezionando complessivamente 42 presenze con il Club della sua città natale. 

Passato poi nel gennaio 2021 in Danimarca al SønderjyskE, Holm arriva in Italia nell’estate 2022 allo Spezia con cui gioca una stagione in Serie A, trasferendosi poi all’Atalanta per l’annata 2023/24, raccogliendo 32 presenze con i nerazzurri e arrivando alla conquista dell’Europa League. 

Nel giugno 2024 il passaggio al Bologna: con la formazione emiliana trova spazio in campo grazie alla sua duttilità oltre alle doti tecniche e fisiche e conquista il suo terzo trofeo in carriera – la Coppa Italia vinta in finale a Roma contro il Milan nel maggio 2025. 

Nel complesso, Holm ha disputato in carriera 74 partite in Serie A con quattro gol e 10 assist, facendo il suo esordio in Champions League negli scorsi mesi sempre con la squadra rossoblu.